第20集 - 大逃亡！被控制的車長寶
車長寶遭到眾人忽略，加上被上田梓問及其存在意義，結果一時想不通而離家出走。朱雀乘機接近，並把黑卡插入車長寶，使其受到控制。E5出擊對付巨型怪物體，但車長寶卻拒絕合作，更打算造反。

第19集 - 決鬥！新幹線戰士對黑色新幹線戰士
眾人聯手對抗黑色新幹線戰士，但不敵落入下風。楓醒來告訴龍司人與人互相信任的重要性，後者若有所思。龍司及時趕到參戰，但單挑黑色新幹線戰士落敗。聽過隼人一番說話後，龍司決定嘗試相信別人。

第18集 - 漆黑敵人！黑色新幹線戰士現身
各地新幹線戰士駕駛員進行聯合演習，但龍司依舊反對讓隼人等與敵人作戰。隼人請求未來等訓練其作戰技巧，以爭取龍司承認。龍司因母親情況轉差而要回去察看，青龍卻在此時駕駛黑色新幹線出現。

第17集 - 移師西方！新幹線戰士對大阪名產
隼人偕秋田與貫去到京都鐵路博物館探訪北斗，但後者因為事忙而暫時無法抽身。隼人乘機前往三條新幹線集結的新大阪站飽覽各款列車。敵人用相機鏡片製造巨型怪物體，強大對焦能力令新幹線戰士陷入苦戰。

第16集 - 爆發！未來和隼人的雙重閘口斬擊劍
蜘蛛怪再度出現，隼人感冒發燒，由其餘三人出動應戰。秋田與貫不敵被擒，未來卻因為暈浪而被迫撤退。未來請求隼人代她駕駛H5出戰，但後者認為她不能如此輕易放棄任務，兩人於是攜手出擊。